运行chkdsk工具修复磁盘的操作步骤如下：

1、Win+R打开运行窗口。

2、在运行窗口的打开栏内输入：cmd，并回车即打开命令提示符窗口。

3、在此窗口输入以下命令可了解chkdsk的使用方法：chkdsk /? 

例如，检查并修复D分区就可输入：chkdsk G: /f

回车后就会启动chkdsk磁盘检查工具扫描G分区了，检查其他分区类似。